Buscando por ahí, encontré un tutorial, con un buen explicativo, de como hacer calidad de servicio QoS, en el MikroTik.
Explica con una introducción, luego hace algunas suposiciones y empieza con el marcado de paquetes, creando la disciplina de tráfico y luego el encolamiento mas una optimización.
El artículo esta en inglés pero sirve mucho, tiene capturas de pantallas.