Buscando entre algunos radius disponibles gratuitos me encontré con Access Manager, un sistema administrador de HotSpot gratuito.
El framework esta escrito en PHP y permite levantar un Freeradius y a través del portal se podrá proveer conectividad a través de HotSpot. Se pueden aplicar políticas de ancho de banda, planes de servicios, etc.
Lo bueno que tiene es la integración con PayPal y la generación de vouchers. El sistema soporta multi routers porque es un radius, tan solo hay que relacionarlo con un router configurando el radius cliente del mismo. En MikroTik se realiza en /radius.
Hay un demo online para ver la interfaz como se administra y tiene un foro con algunos tips de la aplicación.
Access Manager: Free HotSpot Management Software